エクソームシーケンス解析サービス

特長

キャプチャープローブを用いてゲノムDNAからコーディング領域のDNAを濃縮、シーケンシングすることで特定領域に絞った変異解析を実施します。エクソン領域の遺伝子変異はアミノ酸置換を伴う変異に影響を与える可能性があり、全ゲノムを対象にしたシーケンス解析よりも低コスト、効率的、信頼性の高い（高カバレッジ）のデータを取得することができます。キャプチャープローブは実績多数のアジレント社SureSelectターゲットエンリッチメントシステムを利用します。

解析方法

ゲノムDNAにエクソン領域配列と相同性のあるキャプチャープローブをハイブリダーゼーションさせ、解析対象領域となるDNA配列を回収し、シーケンス解析へ進めます。ヒトの場合、利用するキャプチャープローブによって推奨するシーケンス量が異なります。データ解析においては、既知のゲノム配列（リファレンス配列）にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。

解析結果

データ量により、DVD-R、USBメモリ、HDDのいずれかで納品します。

● シーケンス解析のみをご依頼の場合
　・解析報告書（シーケンス結果サマリー）
　・サンプル初期チェック結果報告書
　・シーケンスデータ一式（Fastq形式）

データ解析をご依頼の場合【有償オプション】

　・リファレンス配列へのマッピングデータ（bam形式）
　・SNP, InDel解析結果（Excel形式）

遺伝子変異解析

各染色体部位において検出した遺伝子変異情報（SNP, short InDel）をエクセルファイルにて報告します。変異情報としては①変異を検出した染色体部位（染色体番号、塩基番号）②変異情報（標準／変異塩基配列情報、シーケンス頻度）③変異箇所の遺伝子情報（遺伝子名、各種データベースID、変異頻度など）となります。

必要サンプル条件

ゲノムDNA　3.0μg以上（濃度　50ng/μl以上）

解析費用

解析費用は「ライブラリ調製～シーケンス解析」、「データ解析（ご希望の場合）」、「ハードディスク（検体数が多い場合）」より構成されます。
お問い合わせフォームよりご希望の生物種、SureSelect試薬バージョン、シーケンスデータ取得量、データ解析有無のご希望をお知らせください。

納期

サンプルお預かりより約2か月

ご依頼方法

解析依頼書の確認事項に同意・捺印いただいた上で、ご所属・ご氏名・サンプル情報などの必要事項をご記入いただき、サンプルと合わせてお送りください。

(クラボウ担当者から解析依頼書はご案内いたします)

サンプル送付方法

サンプルは十分量のドライアイスを同梱し、下記宛先まで冷凍便にてお送りください。