全ゲノムシーケンス解析サービス

特長

既知ゲノム配列を利用したリシーケンス解析サービスです。ハイエンドシーケンサー Illumina NovaSeq6000での解析でコストパフォーマンスに優れたシーケンスデータを提供します。

解析方法

ゲノムDNAを断片化し、ショットガンシーケンシングを実施します。解析対象となる生物種に応じてデータ取得量を決定します。ヒトの場合では150bpペアエンドシーケンス解析、取得データ量は90Gb（ゲノムカバレッジ約30倍）を推奨しています。
データ解析においては、既知のゲノム配列（リファレンス配列）にマッピングし、それぞれの染色体位置において変異が起こっている確率を算出します。
ヒトの場合は変異解析以外にも、染色体の構造変異、コピー数変異の解析が可能です。

解析結果

データ量により、DVD-R、USBメモリ、HDDのいずれかで納品します。

● シーケンス解析のみをご依頼の場合
　・解析報告書（シーケンス結果サマリー）
　・サンプル初期チェック結果報告書
　・シーケンスデータ一式（Fastq形式）

データ解析をご依頼の場合【有償オプション】

　・リファレンス配列へのマッピングデータ（bam形式）
　・SNP, InDel解析結果（Excel形式、vcf形式）
　・CNV解析結果（Excel形式）
　・SV解析結果（vcf形式）

【遺伝子変異解析】

各染色体部位において検出した遺伝子変異情報（SNP, short InDel）をエクセルファイルにて報告します。変異情報としては①変異を検出した染色体部位（染色体番号、塩基番号）②変異情報（標準／変異塩基配列情報、シーケンス頻度）③変異箇所の遺伝子情報（遺伝子名、各種データベースID、変異頻度など）となります。

【コピー数変異解析】

コピー数変異を検出した染色体領域、コピー数変異情報をエクセルファイルにて報告します。

【構造変異解析】

構造変異を検出した染色体領域、構造変異情報（逆位・転座などの変異情報）をvcfファイル形式にて報告します。

必要サンプル条件

ゲノムDNA　3.0μg以上（濃度　50ng/μl以上）

解析費用

解析費用は「ライブラリ調製～シーケンス解析」、「データ解析（ご希望の場合）」、「ハードディスク」より構成されます。
お問い合わせフォームよりご希望の生物種、解析検体数、データ解析有無のご希望をお知らせください。

納期

サンプルお預かりより約2か月

ご依頼方法

解析依頼書の確認事項に同意・捺印いただいた上で、ご所属・ご氏名・サンプル情報などの必要事項をご記入いただき、サンプルと合わせてお送りください。

(クラボウ担当者から解析依頼書はご案内いたします)

サンプル送付方法

サンプルは十分量のドライアイスを同梱し、下記宛先まで冷凍便にてお送りください。